DNA 6mA免疫沉淀測序 (6mA-IP Seq)
DNA 6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)
N6-甲基脫氧腺苷(6mA)是原核生物和真核生物的DNA修飾類型之一，
在細菌、藻類及植物基因組中廣泛存在，在DNA錯配修復、染色體分離和毒力調節中發揮作用。
6mA免疫沉淀測序(6mA-IP Seq)通過特異性抗體富集6mA甲基化的DNA片段，結合NGS測序技術在全基因組水平上分析6mA修飾信息。
用心服務每一個項目
專注表觀組學10年，提供專業有價值的DNA甲基化完整解決方案；
國內較早開發6mA-seq技術團隊之一, 嚴格的內參質控；
已經完成藻類及動植物及人等多個物種6mA-seq項目經驗;
專業的生物信息分析團隊, 提供更多個性化分析思路和方案。
科學方案設計
從項目方案、樣本處理、建庫測序，到數據分析；
每個項目需要專業、有價值的建議；及時高效的溝通，以保障高質量研究成果。
樣本類型和要求
|
樣本類型 |
樣本要求 |
|
基因組DNA |
總量≥ 5ug; 濃度≥ 50ng/ul; 基于Qubit定量 |
|
動植物、藻類、低等生物等 |
按照送樣要求準備 |
|
備注：用封口膜密封樣品; 干冰運輸 |
|
數據分析
|
6mA-IP Seq |
分析內容 |
備注 |
|
標準分析 |
1、測序數據質量評估 |
過濾掉低質量數據，保證數據質量 |
|
2、與參考基因組比對 |
測序Reads 在基因組上的分布 |
|
|
3、6mAPeak峰Calling |
6mADNA富集區域鑒定 |
|
|
4、6mAPeak圖譜分析 |
6mAPeak在基因組，染色體，功能元件上的分布 |
|
|
6、組間差異6mAPeak分析 |
尋找6mADMR及注釋 |
|
|
7、差異6mAPeak基因分析 |
相關基因GO，KEGG富集分析 |
|
|
高級分析 |
8、多組學整合關聯分析 |
例如與轉錄組關聯分析 |
|
9、其它定制化分析 |
結合課題背景亮點挖掘 |
Copyright ? 2021 | 深圳市艾斯基因科技有限公司 All Rights Reserved. | 粵ICP備16072881號 | 網站建設：中企動力 龍崗